A coleção integra amostras de rochas de diversos pontos do país, destacando-se pelo seu elevado número, as rochas magmáticas.
Merecem referência a coleção histórica de rochas ornamentais portuguesas e a coleção de rochas vulcânicas dos Açores.
Atualmente, apenas uma pequena mostra dos principais tipos de rochas portuguesas está disponível ao público.